本发明公开了一种清晰度自动调焦系统及其的调焦方法，本发明的清晰度自动调焦系统，包括调焦卡盘模块，调焦卡盘模块包括驱动旋转组件、浮动旋转组件、两个产品夹头组件和下压驱动组件，浮动旋转组件位于驱动旋转组件的下方且与驱动旋转组件相连；两个产品夹头组件分别可移动地设置在浮动旋转组件的下方相对两侧且位于浮动旋转组件的同一直径方向上，两个产品夹头组件与浮动旋转组件相连；下压驱动组件驱动两个产品夹头组件使得两个产品夹头组件彼此相对靠近地移动以夹住螺纹镜头以及彼此背离地移动以释放螺纹镜头。该清晰度自动调焦系统，可以实现对螺纹镜头的自适应调整，以便拍摄到清晰的测试图像来进行测试，结构简单，操作方便，通用性好。