本发明提供了一种fx域相干性噪音压制方法及系统，属于地震勘探资料处理领域。所述方法包括：S1，数据准备：采集加载完观测系统后的地震单炮记录；S2，依次对地震单炮记录中的每道记录设计扇形滤波器，并计算获得每道记录的相干噪音，所有道的相干噪音构成完整的相干噪音；S3，从地震单炮记录中减去完整的相干噪音获得相干噪音压制后的地震记录。通过对某探区实际资料处理前后的效果分析可以看出，本发明对该探区的野外采集的单炮中的相干噪音干扰具有非常好的应用效果，在对相干噪音进行压制的同时，能够保护有效信号，提高了地震资料的信噪比。