本发明提供了一种可控震源黑三角噪音压制方法及系统，属于可控震源激发地震资料数据处理领域。所述可控震源黑三角噪音压制方法首先对地震数据进行傅里叶变换，然后采用相关法在不同的频带范围内求解噪音压制算子矩阵，最后采用稀疏约束反演迭代算法，实现可控震源黑三角噪音的有效压制。本发明采用稀疏约束反演迭代的方法进行可控震源“黑三角”噪音压制，通过差异匹配和约束反演，实现差异最小，通过反复迭代更新，可实现最优的噪音压制处理，本发明的数据适应性更好。