本发明公开了一种连续制备5‑羟甲基糠醛的方法，包括：将果糖基碳水化合物和杂多酸催化剂加入反应器中，在含有低沸点极性有机溶剂与无机盐水溶液的反应介质中，使果糖进行分子内脱水反应；反应结束后，反应体系分为有机相和水相；有机相脱色提纯后得到5‑羟甲基糠醛。本发明制备的固体酸催化剂在高温时溶解度增大，以液体酸形式催化果糖脱水，极大程度上提高了催化效率和产物收率；反应结束降温后溶解度减小以固体形式析出，便于催化剂回收利用。本发明涉及的材料来源广泛，价格低廉，环境友好，符合绿色化学的要求，为产品的工业化生产创造了良好的条件。