本发明提出一种5‑羟甲基糠醛的制备方法及其制备装置，属于精细化工技术领域。所述制备方法包括如下步骤：将反应液和有机溶剂加入到碳化硅微通道反应器内进行反应，得到含有5‑羟甲基糠醛的混合物；将所述含有5‑羟甲基糠醛的混合物在第一分相器进行分相，得到有机相和水相；将所述有机相进行蒸发浓缩，得到含5‑羟甲基糠醛的粗产品及有机溶剂；将所述水相转入萃取装置与有机溶剂混合进行萃取，将得到的萃取产物转入第二分相器内进行二次分相，将得到的二次有机相转入第一分相器中。本发明提供的制备5‑羟甲基糠醛方法，产率高，能耗低，且副产物少。