本发明公开了一种蒙皮换热旁路控制系统及其控制方法，属于电子设备热管理的技术领域，分别设定介入边界条件和退出边界条件；当T0和T1满足介入边界条件时，所述蒙皮换热旁路介入电子设备的散热通道；当T0和T1满足退出边界条件时，所述蒙皮换热旁路退出电子设备的散热通道；其中，介入边界条件和退出边界条件中的边界值之间设有过渡区间，当T0和T1位于过渡区间时，则蒙皮换热旁路维持当前所处状态，蒙皮换热旁路根据冷却工质和引气的温度状态选择介入或退出所述散热通路，以达到充分发挥蒙皮换热器在低温环境工况下的散热优势，同时避免蒙皮换热器在高温环境工况对散热的不利影响，以最小的代价为电子设备平台提供更强散热能力的目的。