本本发明公开了基于稠密点云修补三维模型水面漏洞的方法，包括以下步骤：S1航拍影像：通过航拍设备在设定区域上空拍摄影像，将所拍影像传输至控制端；S2训练神经网络模型：控制端将S1中航拍影像制成射影像图或者正下视图像，并将射影像图或者正下视图像输入神经网络模型，神经网络模型识别水面对象和漏洞区域。本发明提出的基于稠密点云修补三维模型水面漏洞的方法，将航拍影像图生成正射影像图，将所拍影像传输至控制端，控制端设置有DOM影像生成系统和稠密点云生成系统，稠密点云与神经网络结合来进行预测水面对象和修复漏洞，通过神经网络模型快速定位水面和漏洞区域范围，修复模型能够对缺失的点云信息进行快速填充。