本申请提供一种主动短路控制方法、电机控制器及电机控制系统，该方法适用于T型三电平逆变器。T型三电平逆变器包括并联的三相电路，一相电路包括一个竖桥和一个横桥，竖桥的上、下桥臂串联后并联于直流电源两端，横桥桥臂一端连接参考地，另一端连接竖桥的上、下桥臂的串联连接点，直流电源的正/负极分别通过一个电容连接参考地，各竖桥上、下桥臂的串联连接点连接电机。该方法包括：控制三相电路的竖桥和横桥中开关管的通断，以将直流电变换为三相交流电供给电机使用；当T型三电平逆变器进入主动短路工作模式时，导通每相电路同一桥臂的开关管，并关断每相电路其他桥臂的开关管以短路电机。本申请可提高T型三电平逆变器的安全性和可靠性。