本发明公开了一种多重PCR结合磁分离检测食源性致病菌用磁分离装置，包括：底座，设在底座上的螺纹轴和限位柱；架设在螺纹轴和限位柱间的螺杆；螺杆一端与固定块转动连接，固定块套设在螺纹轴上；螺杆上螺接有多个第一滑块，多个第一滑块的同侧连接有限位杆；多个样品管，样品管与第一滑块固接；封堵组件，包括壳体、压缩弹簧、封堵球；第一支杆，其一端通过第二滑块螺接在螺纹轴上，第一支杆设有多个磁棒；第二支杆，其一端通过第三滑块螺接在螺纹轴上；第二支杆设有多组接料斗组。本发明具有的有益效果是，避免多次人工转移样品造成的样品污染，操作方便，实用性强，实验精确性高。