本发明涉及一种基于全卷积自编码器的高光谱影像异常探测方法。本发明结合全卷积自编码器网络，将高光谱遥感影像异常探测问题转换为背景与异常分离问题，网络直接重建背景，异常表现为网络重建误差，从而实现探测。构建残差连接的自适应加权全卷积自编码器，输入均匀噪声拟合原始高光谱影像以重建背景，通过卷积和残差连接保持重建背景空间细节信息，并设计了自适应加权损失函数抑制异常被重建，实现网络重建结果中背景与异常的分离。本发明可以解决高光谱遥感影像深度学习异常探测问题，实现全自动端到端异常探测，无需参数设置，可以获得更佳的异常探测结果。本发明可以有效提升高光谱异常探测的适用性和精度。