本实用新型公开了一种微生物发酵用反应器，包括器体、反应腔、进液管和排气管，所述反应腔内部设置有搅拌结构，所述搅拌结构包括导液管、出液口、导向板、挡板、搅拌杆、电机和开关，所述导液管两端分别固定在进液管和反应腔上，所述导液管底端均等固定有出液口，且出液口内部皆固定有导向板，所述导向板延伸至出液口外侧的一端皆固定有挡板。本实用新型解决了现有的微生物反应器内部的原材料和微生物搅拌不均的问题，提高了原材料的发酵效果，解决了现有的微生物发酵反应器的排气管容易被污染的问题，保证反应腔内部能够正常排气，从而保证发酵效果，提高了反应器的实用性。