本实用新型公开了一种两虫样品真空辅助系统，包括装置主体、电机、转盘、真空罐和排液泵，所述装置主体正面螺栓连接有控制面板，且装置主体顶部螺栓连接有声光报警器，并且装置主体顶部左侧螺栓连接有抽滤接口，同时装置主体顶部右侧螺栓连接有抽液接口，所述电机底部螺栓连接有转盘，且转盘活动连接于转换槽，所述真空罐内壁右侧螺栓连接有液位传感器，且真空罐左侧螺栓连接有连接管，所述排液泵螺栓连接于真空罐左侧，且排液泵左侧螺栓连接有排液口。该两虫样品真空辅助系统，采用自动化吸取上清液的结构，便于检测大量两虫样品时，保持吸取上清液时的稳定，同时设置的可控抽滤装置，可以在对两虫样品进行荧光染色时控制抽液速度。