本实用新型公开了一种自动指纹识别系统，它包括有指纹识别系统和控制系统，所述指纹识别系统包括指纹采集模块、系统控制模块、存储模块、指纹处理模块、输入输出模块和通信接口模块，所述指纹采集模块连接系统控制模块的输入端，所述系统控制模块与存储模块之间相互连接，所述系统控制模块分别连接指纹处理模块和输入输出模块的输入端，所述指纹处理模块连接输入输出模块的输入端，所述指纹识别系统通过内部的通信接口模块与控制系统的输入端相连。本实用新型采用的MBF200电容式指纹传感器通过图像搜索专用技术和高速图像传输技术对各种类型手指进行指纹采集，具有高性能、低功耗以及低成本特点。