本实用新型公开一种灌装系统，涉及灌装领域，分液装置的进液口为顶部开口结构，药液注入分液装置，间断打开进液阀向分液装置内间断注入药液，直到分液装置内充满药液，进而排空分液装置下方的药液，排空过程自动化，无须人工操作，整个灌装系统没有残留气体，灌装精度和合格率高。同时还可设置尾料灌装模式，根据瓶体规格设置好相应的配方参数，可自动从正常生产模式转换到尾液灌装模式，通过实时监测尾料量，根据尾料的量，依次关闭灌装泵的数量，逐步减少灌针头灌装数量的方式，直至实现单针灌装，最大限度的保证产品的灌装合格率，提高尾料的利用率，使药液的浪费降到最低。