本实用新型公开了一种带灭菌过滤功能的微生物酵素发酵装置，包括釜体，釜体的底端中部固定连接过滤筒，所述过滤筒的一侧端贯通连接进气管，所述进气管上安装有热风机，所述釜体的内腔设有转轴，所述转轴的顶端贯穿釜体的顶壁并转动连接在搅拌电机上，转轴内设有气道，所述气道贯通连接过滤筒上，转轴的外圆面均匀的设有若干喷气嘴，转轴的外圆面底端套设有转盘；本实用新型的整个搅拌过程是利用高速气流搅动发酵液，促进发酵液进行混合，且能有效的防止微生物被破坏，能大幅提升发酵质量；同时转轴带动转盘旋转，进而利用转盘带动搅拌叶搅动釜体内的发酵液，能进一步促进发酵液与高温气体的快速混合，能进一步提升微生物的发酵质量。