本实用新型公开了一种用于制备眼药水的发酵装置，涉及药品制备技术领域。本实用新型包括第一发酵筒、第二发酵筒和第三发酵筒，所述第一发酵筒与第二发酵筒之间和第二发酵筒与第三发酵筒之间分别通过法兰固定连接，所述第一发酵筒、第二发酵筒和第三发酵筒的内部均设置有搅拌机构。本实用新型通过设置第一发酵筒、第二发酵筒和第三发酵筒，三级发酵的设计使得能彻底发酵好，且第一发酵筒、第二发酵筒和第三发酵筒内的发酵参数相互独立，眼药水中药可经过不同阶段进行发酵，提高发酵效果，且三个发酵筒可实现连续发酵，提高发酵效率，且在发酵过程中，可随时添加发酵液，进一步提高发酵效果。