本实用新型涉及光束扫描技术领域，且公开了一种红外光束扫描系统结构，包括安装板，所述安装板左侧的上方分别固定连接有可调谐激光光源和分束镜，所述分束镜位于可调谐激光光源中部的右侧，所述安装板上安装有位于分束镜下方的斩波器和准直器一，且斩波器位于准直器一的正上方，所述安装板正面中部的右侧分别固定连接有载物台。该红外光束扫描系统结构，通过系统硬件和处理软件配合作用，并且采用可调谐激光光源的设计，可实现腔体内样品透过率的二维扫描，得以对样品微区透过率的采谱及数据处理，同时配合装置中两个准直器的共同使用，能够减少光束的散射，不仅使得精准度高，而且实用高效，是装置可行性的体现。