本实用新型公开了一种复合微生物发酵装置，涉及发酵设备领域，为解决现有技术中的现有的发酵设备在针对不同发酵产品时，设备的结构使用不灵活的问题。所述装置壳体的内部设置有反应漏斗，所述反应漏斗的两侧均安装有连接架，所述装置壳体的一侧设置有进气管，所述装置壳体的上端面安装有连接板，所述连接板的上方安装有盖板，所述盖板的下端面设置有密封圈，所述盖板的上端设置有进料口，所述进料口的上端面设置有口盖，两个所述进料口的下方均安装有进料管，所述装置壳体的两侧均安装有加热器，所述加热器的上端安装有固定板，所述装置壳体的内表面设置有保温层，所述反应漏斗的下端设置有第二出料管。