本实用新型公开一种星载GNSS掩星接收机系统，包括定位天线、掩星天线和接收端机，所述接收端机分别与所述定位天线和所述掩星天线连接，所述接收端机包括射频部组件、基带部组件、接口部组件、星务数传单元、供电选通单元和时钟单元，所述射频部组件的数量与天线的数量相同，每个所述射频部组件分别与一个天线和基带部组件连接，所述基带部组件均与所述接口部组件连接，所述接口部组件与所述星务数传单元连接，所述供电选通单元为所述接收端机的其他部分供电，所述时钟单元为所述接收端机提供系统时钟。本实用新型为每个天线配备独立的射频部组件和基带部组件，可以更好的处理天线信号，同时功耗低，适配各种卫星供电系统。