本实用新型涉及分子分离支架加工的技术领域，特别是涉及一种质谱仪分离支架的加工机构，其通过设置多组调节插孔，便于使第二油缸输出端插装在多个位置的调节插孔上，进而增加加工平台横向移动行程，提高使用实用性；包括支撑架、固定支架、油缸座板、第一油缸、导滑块、固定板、第二油缸、调节板、调节插孔、加工平台、连接块、长导柱、横向滑块和切割机构，两组固定支架后端与支撑架前端中部连接，油缸座板下端与固定支架上端连接，第一油缸内端与油缸座板外端连接，导滑块输入端与第一油缸输出端连接，固定板下端与固定支架上端连接，第二油缸固定安装在导滑块中，调节板上端与加工平台下端连接，调节板下端排列设置有多组调节插孔。