本实用新型公开了一种琼脂凝胶电泳装置，通过琼脂室的第二容纳腔将制备好的琼脂板进行定位、定点放置，而后利用设置在琼脂室下方的定位灯照亮琼脂板的点样孔，使得技术人员能够准确辨别需要进行点样操作的点样孔的位置，同时，为了避免点样时划伤或者损伤琼脂板，本实用新型提出了设置在点样盖上的点样通道，点样通道与点样孔对应，这样，技术人员在进行点样时只需要找准需要点样的点样孔，再通过对应的点样通道即可完成点样操作，避免了肉眼观察所带来的误差干扰，不会损伤琼脂板，可精准完成点样工作，从而达到提高实验效率的目的。