本实用新型涉及一种用在琼脂糖电泳中的琼脂槽制作结构，包括磁性底板和胶梳，所述磁性底板的顶面和底面分别固联有矩形框，所述矩形框与磁性底板组成凝胶槽，位于磁性底板上侧的凝胶槽经由可沿纵向移动的横向磁性隔板分隔成两个第一凝胶腔，其中一个第一凝胶腔经由可沿横向移动的纵向磁性隔板分隔成两个第二凝胶腔，所述纵向磁性隔板与横向磁性隔板通过磁性相吸合固定；所述胶梳包括用于架设在磁性底板上侧的胶梳架，所述胶梳架架设在磁性底板上。本实用新型结构设计合理，通过可移动的横向磁性隔板与纵向磁性隔板对凝胶槽进行分隔与大小调整，便于根据实验需求制作不同大小的琼脂糖凝胶，使用灵活，无需后续再进行切割。