一种复合酶制剂配料装置，包括原料仓和混料罐，原料仓设置在混料罐上方，所述的原料仓内设有水平的第一隔板，第一隔板上布设有多个孔洞，第一隔板将原料仓内分隔为位于上方的储料腔和位于下方的下料腔，储料腔内设有多根竖直的第二隔板，第二隔板将储料腔分隔为多个单独的仓体；原料仓侧壁上设有第一电机，第一电机上设有凸轮，在第一隔板下方设有水平且与第一隔板紧贴的活动板，活动板上布设有多个孔洞，活动板一端设有延伸块，延伸块穿过原料仓侧壁并延伸至原料仓外，位于原料仓外的延伸块部分与凸轮位于同一水平面上且与凸轮接触。本新型采用上述结构，能够有效提高复合酶制剂的配料效率，解决现有配料过程中原料酶被破坏的问题。