本实用新型公开了一种冻干机快速降温系统，包括：第一循环流路，其包括通过管路串联的具有入口端和出口端的冷凝器和第一循环泵；第二循环流路，其包括通过依次通过管路串联的具有入口端和出口端的第一热媒阀、第二循环泵、电加热件和干燥箱组件；第一支路，其一端连接在干燥箱组件的出口端与第一热媒阀的入口端之间，其另一端连接在第一循环泵的出口端与冷凝器的入口端之间，第一支路上设有一第二热媒阀；以及第二支路，其一端连接在第一热媒阀的出口端与第二循环泵的入口端之间，其另一端连接在冷凝器的出口端与第一循环泵的入口端之间。本实用新型利用冷凝器预冷硅油，对干燥箱组件快速降温，以满足特需药品生产，降低设备能耗，节约成本。