本实用新型公布了一种益生菌活化装置，属于微生物装置领域，它包括箱体，第一隔板将箱体分隔为第一活化腔和第二活化腔两部分；第一活化腔内设置有搅拌加热装置，搅拌加热装置包括硅橡胶加热叶片，硅橡胶加热叶片安装在转轴上，转轴连接在电机的输出轴上，电机位于箱体的顶盖上且由电机支撑装置进行支撑固定，电机与电源及控制器相连通，第一活化腔一侧开设有进料口；第二活化腔内通过第二隔板及第三隔板分隔为格子式空间，第二隔板和第三隔板内均设置有中间硅橡胶加热板，第二活化腔一侧开设有出料口，混合液体从第一活化腔溢流到第二活化腔内再从出料口流出。本装置能够进一步优化加热的均匀性，从而保证活化的效果，提高益生菌活化的效率。