本实用新型公开了一种医用吻合器，包括枪身和击发杆，所述枪身的一侧外壁设置有活动套，且活动套的上下两侧外壁均贯穿有第一固定螺栓，所述第一固定螺栓的内侧安装有活动杆，且活动杆的下方外壁安装有支撑杆，同时支撑杆通过螺纹轴与活动杆相连接，所述活动杆的前后两侧外壁均安装有刻度表，且活动杆的一侧安装有连接杆，所述连接杆的一侧外壁安装有卡块，且卡块与卡槽配合安装，所述卡槽开设在活动杆的一侧外壁表面，且卡槽的上下两侧外壁均贯穿有第二固定螺栓。该医用吻合器中，在使用时可以方便对所需切割缝合的位置进行细致测量，避免无法对所需切割缝合位置进行测量，导致深度有偏差，从而有效的提升了该装置的使用效果。