本实用新型公开了一种干细胞分离控制装置，包括细胞离心机本体，细胞离心机本体的内端设置有圆槽，圆槽的内端转动安装有旋转座，旋转座的顶部设置有四个罐槽，四个罐槽的内端均固定安装有样品罐，样品罐的顶端设置有罐盖；本实用新型的有益效果是：本实用新型一种干细胞分离控制装置，通过在样品罐的顶部设置多个管槽可以同时放置较多的样品管进行干细胞分离，分离效率较高，通过设置保温机构可以有效地对样品管进行加热和保温，电热丝使储液箱和若干个分液管发热，储液箱的顶部与样品管的底部相接触，若干个分液管以管槽的轴心为阵列中心呈环形阵列分布，从而快速地将热量传递给样品管，且样品罐的罐壁内设置有保温层，保温效果较好。