一种合盖自动校准系统，包括箱体和箱盖，箱体上设有若干支与箱盖相连的电动推杆，电动推杆包括推杆驱动器和连接在推杆驱动器输出端的推杆，电动推杆带动箱盖对箱体进行盖合或开启，还包括：控制模块，用于控制电动推杆进行箱体的开盖或者合盖，并在每次合盖或者开盖后清除每支推杆产生的行程误差；转动检测模块，转动检测模块位于推杆驱动器内，通过电磁感应检测推杆的转动圈数以确定推杆的伸缩量。本实用新型通过转动检测模块检测推杆的伸缩量，并且通过控制模块进行逻辑分析后控制推杆驱动器的输出功率，进而各个电动推杆达到同伸缩量，使得箱盖的开合速度更为平稳，不会受到位置阻力不同的影响。