本发明提供了一种多维一体的车载磁悬浮飞轮电池控制系统，属于车载飞轮电池控制技术领域。本发明将电流规整模块处理后电流信号作为支持向量机位移预测模块的输入信号，支持向量机位移预测模块的输出信号、模糊PID交叉反馈控制模块和神经网络逆解耦控制模块输出且经累加和坐标系转换模块处理后的信号作为改进零功率控制模块的输入信号，支持向量机位移预测模块输出的位移信号、改进零功率控制模块的输出信号作为线性闭环控制器的输入信号，线性闭环控制器的输出作为模糊PID交叉反馈控制模块和神经网络逆解耦控制模块的输入信号。本发明精简了整个系统的复杂性，实时响应特性大大提高，不仅可以抑制陀螺效应，提高稳定性，又降低能耗和成本。