本发明公开一种本发明提出的多联热泵水暖系统及其控制方法中，多联热泵水暖系统由室外机、若干室内机、水暖供水模块、水泵反馈信号获取模块、异常判断模块构成，异常判断模块获取直流变频水泵的反馈信号，计算反馈信号的占空比，查找异常占空比与水流量关系列表得到异常占空比，将当前反馈信号的占空比与异常占空比进行比较，根据比较结果判断水暖水路是否存在堵塞情况或水泵是否发生异常，从而对多联热泵水暖系统的工作状态进行及时判断，在不额外增加传感器，无需额外布线的情况下，有效解决为检测水路堵塞情况存在的系统设计成本高级布线复杂的技术问题。