本发明涉及河道抑咸的技术领域，公开了潜伏式抑咸活动拍门结构，包括固定在河道中且沿着河道朝上纵向布置的框架体，框架体呈镂空布置，框架体具有朝向涨潮方向的涨潮侧以及朝向落潮方向的落潮侧；框架体的涨潮侧设置有柔性遮挡膜，柔性遮挡膜的上端与框架体的顶部边缘连接，柔性遮挡膜的下端活动布置；柔性遮挡膜上连接有多个横向条，横向条沿着柔性遮挡膜的宽度方向延伸布置，且多个横向条沿着柔性遮挡膜的高度方向间隔布置通过在河道的底部设置框架体，框架体上设置有柔性遮挡膜，当涨潮时，柔性遮挡膜被抵压在框架体上，阻挡河道底部的盐水楔上溯，削弱咸潮的上溯强度，在落潮时，水流冲开柔性遮挡膜朝上弯曲，不会对水流的流动造成阻挡。