本发明公开了一种基于闪烁法测量区域蒸散总水量的方法。方法是通过大口径闪烁仪的路径积分效应测得区域大气的波文比、空气密度、空气比热容、大气折射率结构参数、平均感热通量，再通过下垫面热平衡方程计算得到整体区域的平均潜热通量，最后得出区域蒸散总水量。本方法可用于对观测区域蒸散总水量值的计算。这种通过大口径闪烁仪的路径积分效应测量地表热通量，很好地解决了通量观测中单点观测设备由于下垫面不均一带来的区域总水量不能正确统计问题，可以和卫星数据进行订正，得到更大尺度的整体蒸散数据。