一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法
授权
摘要
本发明公开了一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，包括：基于全外显子测序数据及转录组测序数据通过软件进行质控、比对等步骤获取新生突变肽库；使用HLA分型预测软件预测HLA‑I类分型；结合单细胞TCR测序及单细胞转录组测序，通过细胞类型注释、克隆频率分析寻找癌症特异性的CD8+T细胞受体；同时，基于集成深度学习通过peptide‑TCR相互作用预测模型鉴定短肽免疫原性，提出融合单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，解决了传统肿瘤抗原筛选方法新生抗原错选漏选率高、免疫原性不足等问题。
基本信息
专利标题 ：
一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN113160887A
申请号 ：
CN202110443345.4
公开（公告）日 ：
2021-07-23
申请日 ：
2021-04-23
授权号 ：
CN113160887B
授权日 ：
2022-06-14
发明人 ：
蒋庆华许召春王平平周文洋
申请人 ：
哈尔滨工业大学
申请人地址 ：
黑龙江省哈尔滨市南岗区一匡街2号科学园2E栋
代理机构 ：
西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人 ：
姬莉
优先权 ：
CN202110443345.4
主分类号 ：
G16B20/50
IPC分类号 ：
G16B20/50 G16B50/00 C12Q1/6869 C12Q1/6886 G16B5/00 G16B30/10 G16B30/20
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B20/00
特别适用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如基因型-表型关联的ICT
G16B20/50
突变
法律状态
2022-06-14 ：
授权
2021-08-10 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 20/50
申请日 : 20210423
申请日 : 20210423
2021-07-23 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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