测序数据质量控制方法及系统
实质审查的生效
摘要
本发明提出了测序数据质量控制方法及系统,属于基因测序数据处理技术领域,针对测序数据质量处理不支持多线程、处理速度慢的问题,控制方法包括:读取FASTQ数据至内存并切割成数据块,将处理之后的数据块放入内存池中;不断从内存池中检测所需数据块并取出,把取出的数据格式化成的Read类对象,之后对每个Read类对象按照质量控制流程进行处理;将按照质量控制流程进行处理后的统计信息合并到一起,并进行可视化输出。本发明使得质量控制这项任务完全可以在普通的PC机上高效率完成。
基本信息
专利标题 :
测序数据质量控制方法及系统
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN114489518A
申请号 :
CN202210308643.7
公开(公告)日 :
2022-05-13
申请日 :
2022-03-28
授权号 :
暂无
授权日 :
暂无
发明人 :
刘卫国闫立峰殷泽坤赵展
申请人 :
山东大学
申请人地址 :
山东省济南市高新区舜华路1500号
代理机构 :
济南圣达知识产权代理有限公司
代理人 :
李圣梅
优先权 :
CN202210308643.7
主分类号 :
G06F3/06
IPC分类号 :
G06F3/06 G06F9/50
IPC结构图谱
G
G部——物理
G06
计算;推算或计数
G06F
电数字数据处理
G06F3/048
基于图形用户界面的交互技术
G06F3/06
来自记录载体的数字输入,或者到记录载体上去的数字输出
法律状态
2022-05-31 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G06F 3/06
申请日 : 20220328
申请日 : 20220328
2022-05-13 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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