本发明公开了一种无人机物流配送系统，包括物流箱、无人机和仓储柜体，物流箱包括置物腔室和电池组件，无人机下部设有装卸结构，装卸结构上设有电源输入端一，仓储柜体顶部设置有停机坪，停机坪上设有对中机构，对中机构中间的停机坪上设有装卸口，装卸口的下方设置有置物架和搬运机构，置物架包括至少两个垂直间隔布置在支撑柱上的置物板，每个置物板的中间设置有搬运通道，外部环绕布置有至少两个仓储位，仓储位的前端朝远离搬运通道的方向布置并设有充电接口，后端朝靠近搬运通道的方向布置。该无人机物流配送系统能实现物流箱的精准装卸，物流效率高，且仓储柜体的空间占用小、无人机续航长，便于实施。