本发明公开了一种体温筛查系统误差实时修正方法，包括以下子步骤：包括以下子步骤：步骤1：通过红外测温系统获得一段时间T内的人体额温数据和环温数据；步骤2：计算人体额温数据和环温数据的均值；步骤3：计算平均额温数据与真实额温数据的误差；步骤4：对额温输出数据进行误差修正。本发明通过环温与额温的关系实时估算理想额温，达到修正测温的目的；同时减少现场黑体的使用，降低测温系统的功耗以及成本，是一种简单、易实现的方案。