本发明涉及一种耦合大尺度环流气候信息的咸潮上溯预报系统和方法，该系统包括数据输入模块、模型预报模块和数据输出模块。该耦合大尺度环流气候信息的咸潮上溯预报系统通过对需要预测受咸潮上溯影响地区的地区获取历史影响咸潮上溯的水文气象数据，依据从数据中筛选出关键影响因子建立咸潮上溯预报模型，并对咸潮上溯预报模型进行验证，验证通过的咸潮上溯预报模型输出的含氯度作为某个地区咸潮上溯的预报数据；该耦合大尺度环流气候信息的咸潮上溯预报系统得到的预报数据精度高，解决了现有咸潮上溯预报模型对数据要求高、信息获取成本大，且存在预报因子互相关的干扰，使得预报精度低的技术问题。