基于位置特异性得分矩阵的囊泡转运蛋白识别方法及识别设备
授权
摘要
基于位置特异性得分矩阵的囊泡转运蛋白识别方法及识别设备，本发明涉及囊泡转运蛋白识别方法及识别设备。本发明的目的是为了解决现有囊泡转运蛋白的识别方法效率低、成本高的问题。过程为：S1、获取蛋白序列数据文件；S2、基于S1生成位置特异性得分矩阵，并采用AATP算法从位置特异性得分矩阵中提取特征向量；S3、使用不平衡处理算法得到处理后的特征向量；S4、采用MRMD算法得到特征向量集合；S5、采用XGBoost作为分类器，并进行超参数优化；S6、得到训练好的分类器模型；S7、将待测数据集输入训练好的分类器模型得到分类结果，完成对囊泡转运蛋白的识别。本发明用于蛋白识别领域。
基本信息
专利标题 ：
基于位置特异性得分矩阵的囊泡转运蛋白识别方法及识别设备
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN113764043A
申请号 ：
CN202111063261.4
公开（公告）日 ：
2021-12-07
申请日 ：
2021-09-10
授权号 ：
CN113764043B
授权日 ：
2022-05-20
发明人 ：
汪国华宫越邹权
申请人 ：
东北林业大学;电子科技大学长三角研究院（衢州）
申请人地址 ：
黑龙江省哈尔滨市香坊区和兴路26号
代理机构 ：
哈尔滨市松花江专利商标事务所
代理人 ：
张换男
优先权 ：
CN202111063261.4
主分类号 ：
G16B30/10
IPC分类号 ：
G16B30/10 G16B40/00 G16B50/30 G06K9/62
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B30/00
特别适用于对核酸或氨基酸进行序列分析的ICT
G16B30/10
序列排列；同源搜索
法律状态
2022-05-20 ：
授权
2022-02-25 ：
著录事项变更
IPC(主分类) : G16B 30/10
变更事项 : 发明人
变更前 : 汪国华 宫越 邹权
变更后 : 赵玉茗 汪国华 宫越 邹权
变更事项 : 发明人
变更前 : 汪国华 宫越 邹权
变更后 : 赵玉茗 汪国华 宫越 邹权
2021-12-24 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 30/10
申请日 : 20210910
申请日 : 20210910
2021-12-07 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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