染色体三维结构重建方法及装置
授权
摘要
本发明公开了一种染色体三维结构重建方法，包括以下步骤：将Hi‑C相互作用频率矩阵转化为距离矩阵D0；将距离矩阵D0补全，得到补全后的距离矩阵D1；按以下方法迭代求解染色体三维结构：步骤1、根据距离矩阵D1求解染色体三维结构S；步骤2、根据各基因组位点的空间位置计算出染色体三维结构S的固有距离矩阵D2；步骤3、利用D2对D1进行修正，得到新的D1并转至步骤1；步骤4、满足预设条件后停止迭代并输出当前的染色体三维结构S。本发明还公开了一种染色体三维结构重建装置。本发明在ShRec3D算法基础上进行改进，利用重建出的染色体三维结构的固有距离矩阵对补全后距离矩阵进行迭代修正，从而在保持重建速度优势的前提下，大幅提高重建精度。
基本信息
专利标题 ：
染色体三维结构重建方法及装置
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN113808661A
申请号 ：
CN202111097170.2
公开（公告）日 ：
2021-12-17
申请日 ：
2021-09-18
授权号 ：
CN113808661B
授权日 ：
2022-06-10
发明人 ：
李防震
申请人 ：
山东财经大学
申请人地址 ：
山东省济南市历下区二环东路7366号
代理机构 ：
北京德崇智捷知识产权代理有限公司
代理人 ：
杨楠
优先权 ：
CN202111097170.2
主分类号 ：
G16B15/00
IPC分类号 ：
G16B15/00 G06F17/16
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B15/00
特别适用于分析二维或三维分子结构，例如结构或功能关系、结构排序的ICT
法律状态
2022-06-10 ：
授权
2022-01-04 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 15/00
申请日 : 20210918
申请日 : 20210918
2021-12-17 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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