本申请涉及一种电子变压器的双层优化设计方法，分别对电子变压器的下层滤波器和上层变压器进行优化设计，它包括选取相关的决策变量，构建目标函数和约束函数，通过可视化算法将目标函数和约束函数取交集，减小决策变量可行域的范围，最终得到优化设计的解集，再将下层的电感最优解集转化为上层的漏感约束条件，在满足电子变压器和滤波器的诸多非线性约束的前提下，得到最优解的范围，从而完成优化设计。本发明利用变压器的漏感取代电感器的电感，对电子变压器和LC滤波器进行优化设计，减少成本，提高可行性及电路效率。