本发明公开了一种疾病相关标志物的筛选方法、应用及试剂盒。筛选方法包括：使用能够结合免疫球蛋白（Ig）的物质，分别从第一批健康样本血清和患病样本血清中纯化出Ig复合物；将与Ig相结合的蛋白进行蛋白质谱测序分析，比较健康样本与患病样本的差异，找到只出现在患病样本中的差异蛋白，即为该疾病相关潜在标志物。另外还可以通过以下步骤进一步验证该潜在标志物：使用第二批健康样本和患病样本的血清（扩大病例），纯化获得Ig复合物，利用差异蛋白的特异性抗体进行进一步鉴定。该方法先从血清中获得Ig复合物（而不是全血清），再将与Ig相结合的蛋白进行蛋白质谱测序联合特异性抗体分析，能够快速有效地筛选出疾病相关标志物。