一种振动传感器校准系统输出信号控制方法，根据待输出信号频率确定输出所需的采样速率；依据采样速率生成相匹配的输出采样序列，使采样序列的大小满足所需输出信号单周期点数的整数倍以及信号相位从零开始的要求；待数据采集与信号发生器的输出缓存中输出序列倒计数到至零，需要输出最新的写入信号时，计算机开始判断是否达到设定的目标幅值，在未达到设定的目标幅值前根据设定的目标幅值划分的不同幅值信号进行逼近，并自动调整输出信号的幅值，生成新的序列作为输出序列；达到设定的目标幅值后开始计算被校准传感器的特性指标并通过调整幅值逐步衰减振动台振幅或直接切换到下一个频率点。本发明提高振动传感器的校准精度和校准效率。