本发明请求保护一种基于大数据的人群密度预测方法及系统，包括：101对数据进行预处理操作；102根据时间对数据进行划分操作；103根据一定规则构建区域关联图；104对区域关联图数据进行编码处理；105对数据进行特征工程构建操作；106建立多个机器学习模型，并进行模型融合操作；107通过已建立的模型，根据区域的经纬度、所在网格面积等数据预测该区域人群密度。本发明主要是通过对地区的经纬度、网格面积等数据进行预处理和分析提取特征并且构建区域关联图，使用图编码建立多个机器学习模型，从而预测当地区域的人群密度，使得在疫情期间，国家、政府能够对该区域人群密度有所了解，提前分配抗疫资源，部署医护人员等。