本发明公开了一种毒害化学物质的筛查方法，属于化学物质环境健康技术领域。首先，根据区域化学物质生产使用信息，确定目标化学物质清单。其次，对目标化学物质的环境迁移、危害表征和释放潜力数据进行收集，并进行数据质量控制。进一步，对目标化学物质进行危害识别，确定毒害化学物质清单。进一步，构建综合环境健康风险层次模型，并基于层次分析和熵值法，计算各评价指标权重。最后，通过逼近理想解排序法，计算毒害化学物质综合环境健康风险优先级，确定优先控制毒害化学物质清单。本筛查方法的建立，有助于管理部门快速识别区域需要重点管控的毒害化学物质，开展源头控制和过程污染控制，为新污染物治理奠定重要基础。