本发明公开了一种藻类盐度耐受性的快速检测方法。本发明包括以下步骤：S1取测试藻，置于叶绿素荧光测定仪中，照射不同时间，施加饱和脉冲，直到实际光合作用效率达到最大，得间隔时间；S2再次取测试藻，在上述间隔时间下，施加饱和脉冲，按照此间隔时间，不断施加饱和脉冲，直至实际光合作用效率达到稳定状态；S3再次取测试藻，调节盐度，按照步骤S2的方法，得在不同盐度新稳态下的实际光合作用效率；S4绘制测试藻的盐度耐受曲线，与初始状态下的实际光合作用效率相比，大于初始状态下的实际光合作用效率对应的盐度范围即为测试藻的盐度耐受范围。本发明实现了对测试藻的直接检测，操作方便，耗时短，成本低，适用于现场快速检测。