本申请涉及磁悬浮交通工程技术领域，提供一种高速磁悬浮的低置线路结构及其施工方法，低置线路结构包括多个沿低置线路结构的纵向排布的线路单元。线路单元包括承墩板、支墩、轨道板组件以及调节支座。承墩板铺于地基上，支墩设于承墩板上，轨道板组件包括轨道板和功能件，轨道板的横向两端均固定有功能件，沿轨道板横向两端的一对功能件为一组，多组功能件沿轨道板纵向布置，功能件用于实现磁悬浮列车的悬浮、启停及导向。调节支座设置于支墩和轨道板之间，调节支座能够调节轨道板组件竖向位移和/或横向位移。通过调节支座对轨道板组件进行位移调节，实现对于轨道板上固定连接的功能件的间接调节，以满足高速磁悬浮线路结构的高平顺性。