本发明公开了一种种植杯回收码垛系统，包括用于放置种植杯的料斗，用于将种植杯从料斗中一个个放到输送机上的抓取机构，用于将竖向放着的种植杯放倒的倒置机构，用于输送种植杯的输送机，所述输送机的输送皮带的两侧设置有侧挡板，用于检测种植杯是否损坏的检测机构，用于将有破损的种植杯从输送机上推出的推出机构，所述输送机对应推出机构的位置不设置侧挡板，用于将种植杯叠放的码垛装置，用于将输送机上横向输送的种植杯转换为竖向输送的换向装置，所述种植杯由硬质塑料制成，其下部设置有供作物根系伸出的条形通孔。实现种植杯的自动化回收，减少工人的劳动强度，减少无土栽培业的固废的产生，减少环境压力。