本发明涉及提取肌醇六磷酸技术领域，具体为一种高纯度肌醇六磷酸的提取方法，包括以下步骤：1)原料盐酸浸泡：将米糠放入5％盐酸浸泡，用于洗掉料液中游离的杂质；2)二级板框过滤：二级板框所填装滤氨型325树脂作为连续离子交换装置的原料液，进行过滤；3)连续离子交换法提取：采用梯度解析的原理，树脂首先接触含量弱的碱，解析逐渐加强，即利用肌醇六磷酸被树脂交换吸附，流出物为废液；4)蒸发结晶；本发明过米糠、5％盐酸浸泡、二级板框过滤、连续离子交换法提取以及蒸发结晶的流程，一步将肌醇六磷酸从料液中提取出来，简化了工序，同时也缩短生产周期，提高纯度，纯度经验证可达99％以上。