本发明公开了一种转子轴打磨装置，打磨装置包括主机、两个箱体，其中，两个箱体相对设置且其中一个箱体安装在主机侧部，而另有一个箱体与主机之间加工台，主机和加工台上设有用于固定转子轴并驱动转子轴旋转的固定部；两个箱体之间设有承载台，承载台上设有第一导轨，承载台可相对两个箱体滑动以靠近或远离加工台；第一导轨上滑动设置有立柱，立柱上安装有打磨盘组件，且承载台上设有喷水机构，喷水机构的输出端位于打磨盘组件与转子轴的接触部位的上方；本发明在打磨盘组件对转子轴打磨的同时对打磨液和打磨掉落的渣屑进行自动分离，并对分离后的打磨液进行回收循环利用，从而起到节省能源的作用。