本发明公开了一种钻孔取芯装置及钻孔取芯方法，包括钻杆、岩芯管、返水接头和钻头；所述钻杆中具有钻杆流道，所述返水接头具有接头流道和返水流道；所述岩芯管中设置有芯管堵头，所述岩芯管中设置有中心管，所述中心管中具有开关结构；所述中心管与所述岩芯管之间形成有返水腔，所述堵头上设置有堵头流道，所述岩芯管的管壁上具有管壁返水口；在所述钻孔取芯装置处于冲孔状态时，所述开关结构处于开启状态；在所述钻孔取芯装置处于取芯状态时，所述开关结构处于关闭状态。本发明公开的钻孔取芯装置及钻孔取芯方法，在取芯时水是从岩芯的底部向上流动，不会直接冲刷岩芯，起到保护岩芯的作用，有利于在松散岩层的钻孔中取芯。